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Las PLANARIAS presentan un sistema excretor de CÉLULAS FLAMÍGERAS, muy sencillo. Presentan una serie de ramificaciones laterales, que son células modificadas encargadas de extraer las sustancias del cuerpo. La eliminación se realiza por un orificio bucal. El aparato excretor de las Planarias es rudimentario y está constituido por los PROTONEFRIDIOS, compuestos por células flamígeras filtradoras que poseen cilios vibrátiles. Como las planarias tienen muy poco espesor, los desechos metabólicos pasando a través de los delgados tegumentos del animal y pueden ser expulsados por simple DIFUSIÓN.
La eliminación del agua y otros metabolitos se realiza mediante un sistema excretor simple consistente en protonefridios. Consiste en un sistema tubular que se abre al exterior por un poro; la ausencia de un riñón central de filtrado se ve compensada por la presencia de unas células especiales que se encuentran repartidas por todo el cuerpo y conectadas al sistema tubular. Estas células son las células terminales del sistema y son las encargadas del filtrado de las sustancias que se han de expulsar; son células en forma de copa que en su interior tienen un hueco con varios flagelos que crean la corriente necesaria para que circulen hacia el exterior.