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El microscopio óptico usa las partículas de luz (fotones) como vehículo para obtener una imagen, haciendo que la luz incida sobre una muestra y que ésta refleje las partículas para poder ser "vista". Usa lentes convexas para lograr el aumento de la imagen.
El microscopio electrónico usa electrones para lograr la reflexión en la muestra, ya que la longitud de onda de los electrones es mucho menor que la de los fotones de luz visible. Eso quiere decir que es capaz de producir muchos más aumentos que un microscopio óptico.
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