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Desde el punto de vista de ecológico se pueden separar los componentes del acuario en abióticos como el agua que lo contiene, las rocas y el sedimento, la luz solar, los minerales y gases disueltos; y los bióticos que son los seres vivos.
Estos a su vez van desde los autótrofos como plantas y fitoplancton que crean materia orgánica, luego los peces que consumen estos seres autótrofos, posteriormente carnívoros que se alimentan de los organismos herbívoros más pequeños, y finalmente microorganismos biontófagos que desintegran materia descompuesta.
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