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Para México están consideradas dos subespecies de lobos; la occidental, Canis lupus baileyi, en inminente peligro de extinción, y la oriental, Canis lupus monstrabilis hoy extinto. (26)
La desaparición del lobo mexicano, del territorio que antaño ocupaba, ha sido ocasionado por la destrucción del hábitat natural de esta especie y por la matanza que se generó al considerársele un peligro para las explotaciones ganaderas que se ubicaron, principalmente, en las regiones del norte del país.
El hecho de realizar campañas de control sin una base científica hace que la población sea dañada seriamente, al grado de dejarla en peligro de extinción, sin siquiera saber un poco de la biología de este animal.
El Equipo de Recuperación del Lobo Mexicano, auspiciado por la USFWS, ha llevado a cabo varias acciones para tratar de corregir esta problemática y, finalmente, lograr convencer a las autoridades de que sea creada un área en donde liberar lobos y que en ésta se encuentren protegidos por la ley.
También, una tarea principal de este equipo es el de aumentar la variedad genética de lo que se conoce como Linaje Certificado (LC), ya que era muy pobre, y el hecho de demostrar la pureza de dos linajes, el Linaje Ghost Ranch y el Linaje San Juan de Aragón, ayuda a aumentar dicha variedad, dando mayores esperanzas de supervivencia de la especie.
Al ir aumentando el número de individuos en cautiverio, surge la problemática de encontrar mas espacios físicos que permitan tener individuos en cautiverio dentro de sus instalaciones, por lo que el ingreso de nuevas instituciones al programa resuelve esta cuestión, aumentando la capacidad de carga del programa.
Parece ser que las acciones, hasta ahora, han sido las correctas, y aún existen esperanzas de salvar a esta subespecie de la extinció