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La síntesis de ATP se realiza a través de una serie de reacciones que se pueden clasificar en dos grandes tipos, la respiración y la fermentación. Ambos términos se utilizan frecuentemente asociando respiración con oxígeno (condiciones aerobias) y la fermentación con la ausencia de oxígeno (condiciones anaerobias), sin embargo, desde un punto vista bioquímico, esa diferenciación es errónea, ya que existen organismos capaces de realizar respiración anaerobia y organismos capaces de realizar fermentación en condiciones ambientales aerobias.
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