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Luego de la instalación de la Junta de Gobierno en Buenos Aires partió desde esa capital una expedición militar para lograr la sumisión de las provincias de la Real Audiencia de Charcas al nuevo gobierno revolucionario.
El virrey del Perú, José Fernando de Abascal, había desconocido a la Junta de Buenos Aires y, a pedido del presidente de la Real Audiencia de Charcas, Vicente Nieto, y del gobernador intendente de Potosí, Francisco de Paula Sanz, anexado provisoriamente las intendencias de esa audiencia al Virreinato del Perú. Nieto tomó conocimiento de la instalación de la Junta el 20 de junio de 1810, tomando el 26 de junio la medida de desarmar a la unidad del Regimiento de Patricios de Buenos Aires que había llevado a Chuquisaca el año anterior, destituyendo a los oficiales y mandando a los soldados sorteados por el método del quintado a trabajar al socavón de Potosí.
Abascal nombró al presidente provisorio de la Real Audiencia del Cuzco, José Manuel de Goyeneche, general en jefe del Ejército Expedicionario del Alto Perú. Este marchó hacia Puno y luego situó su campamento sobre el río Desaguadero.
Nieto envió a su mayor general, José de Córdoba y Rojas, a ocupar el pueblo estratégico de Santiago de Cotagaita con tropas de Chuquisaca y 4 compañías de Potosí al mando del coronel González de Socasa. La posición fue fortificada con fosos y trincheras en espera de la llegada de los refuerzos solicitados al virrey del Perú, mientras Córdoba y Rojas se situaba en Tupiza.