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Muchos virus producen enfermedad en sitios distantes del punto de entrada, diseminándose dentro del huésped por distintos mecanismos, pero las rutas de propagación más comunes son la sanguínea y la linfática La presencia de virus en la sangre se denomina viremia. Los viriones pueden permanecer libres en el plasma (por ejemplo: enterovirus, togavirus) o estar asociados a algún tipo particular de célula, la cual puede también resultar infectada. En muchas infecciones virales la fase virémica es breve.
En algunos virus como los de la rabia, el herpes simple y la polio, ocurren diseminación neuronal hasta alcanzar estructuras nerviosas centrales donde provocarán enfermedad o iniciarán una infección latente.
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