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Es el proceso por el que la célula capta partículas de gran tamaño como los oligosacáridos, proteínas. Ocurre mediante una invaginación de la membrana en la que se engloba la partícula a ingerir. Se produce la estrangulación de la invaginación originándose una vesícula que encierra el material ingerido. Según la naturaleza de las partículas englobadas, se distinguen diversos tipos de endocitosis: Pinocitosis: que implica la ingestión de líquidos y partículas en disolución por pequeñas vesículas revestidas de clatrina, una vez que el contenido de la vesícula ha sido procesado, la membrana de la vesicula vuelve a la superficie celular. La fagocitosis en la que se forman grandes vesículas revestidas o fagosomas que ingieren partículas de gran tamaño, como bacterias, microorganismos y restos celulares. El material sólido dentro de la vesícula es seguidamente digerido por enzimas liberadas por los lisosomas. Los glóbulos blancos constituyen el ejemplo más notable de células que fagocitan bacterias y otras sustancias extrañas como mecanismo de defensa y por ultimo tenemos la autofagia, en la que las membranas del REL engloban el material que se debe reciclar, luego la membrana del REL se una a un lisosoma primario y la unión se denomina lisosoma secundario o autofagolisosoma.