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Medicina nuclear: El tecnecio es el radioisótopo más utilizado en la práctica diagnóstica en la actualidad, aproximadamente el 80% de los procedimientos de medicina nuclear lo utilizan. Es utilizado principalmente en procedimientos de diagnóstico para observar el funcionamiento de los órganos del cuerpo humano. El isótopo no funciona como tratamiento curativo en sí mismo, sino más bien como una ayuda para la formación de imágenes.
Uso químico: Puede usarse como catalizador, sin embargo, su radioactividad es el mayor problema a la hora de encontrar aplicaciones seguras. Protege ante la corrosión usando también aniones por lo que se ha sugerido su uso en reactores de agua en ebullición.
Es utilizado también en el campo industrial para calibrar los equipos científicos.
A pesar de todos sus usos positivos, el tecnecio se encuentra limitado cuando va a ser utilizado a sitios cerrados, esto porque es un material radioactivo sumamente peligroso para el ser humano.