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Hongos saprófitos: Obtienen su alimento de materia orgánica muerta; junto con las bacterias, son responsables de la descomposición de la materia orgánica.
Los parásitos: Se alimentan de organismos vivos (generalmente plantas), causando por lo general enfermedades.
Los mutualistas, que absorben nutrientes de su hospedero, pero le son recíprocos en algunas funciones benéficas (por ejemplo las micorrizas, hongos presentes en casi todas las raíces de las plantas, que ayudan a su buen desarrollo).
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