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En la comunidad de Atzalan dentro de la vegetación que existe está corresponde a un tipo de clima templado húmedo, en su mayoría existen plantas de ornato o de jardinería, plantas alimenticias dentro de las principales encontramos maíz, frijol y árboles frutales, además existe una variedad de plantas medicinales cuyo uso se ve transmitiendo de generación en generación aunque está ya se está perdiendo. También existe la del uso forrajero cuyo principal destino es el de sustento para el ganado bovino productor de leche.
Aunado a esté existe otro tipo de plantas conocidas como aromáticas las cuales se utilizan como condimento en nuestras comidas.
A continuación detallaremos cada una de ellas:
Dentro de las plantas de jardinería estás casi siempre se encuentran adornados sus casas ya sea externamente o internamente dentro de las cuales podemos citar: rosas, claveles, alcatraces, azucenas, noche buenas, tulipán (diferentes colores).
Como plantas de ornato tenemos: pino, trueno, ciprés, jacaranda.
Plantas alimenticias tenemos gran variedad porque entre ellas tenemos los arboles frutales: durazno, pera, ciruela, capulín, guayaba, aguacate, chirimoya, tomate verengeno.
Aunado es esto plantas alimenticias más detalladamente: frijol, papa, maíz, chayote, zarzamora como también plantas hortalizas: rábano, zanahoria, calabaza, lechuga, cebollines, jitomate, lengua de vaca, berro, omequelite, guías de erizo, hacasvio.
En plantas medicinales tenemos: manzanilla, ruda, marihuana, la raíz de huaco, coquillo, pelo de elote, sauco, marrubio, gordolobo, tilia, tejocote, buganvilia…
Dentro de las plantas industriales tenemos arboles de maderas preciosas como son: cedro, roble, pino, aguacate, y además también el elite que se utiliza en la albañilería como poste para cimbra.