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La estructura particular de sus flores y la aparición del fruto como órgano nuevo no es la única diferencia que poseen con el resto de las espermatofitas, otros caracteres morfológicos distintivos son: la reducción del gametofitofemenino a sólo unas pocas células, la doble fecundación (con la formación de un tejido nutritivo característico, triploide, llamado endosperma al tiempo que se fecunda al óvulo), y un xilema y floemadistintivos, más recientes que los del resto de las traqueofitas, y más eficientes en muchos aspectos (aunque el xilema parece haber evolucionado ya dentro del clado siendo las angiospermas más primitivas similares en sus tubos xilemáticos a las Gimnoespermas.
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