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La función del NPC es simple, intercambiar material entre el núcleo y el citoplasma. Del núcleo salen (se exportan) ARN y ribosomas y entran (se importan) polimerasas, histonas, lípidos, etc., en definitiva todas las proteínas necesarias para el funcionamiento de la traducción, y todas las fases del ciclo celular. El transporte a través del poro es muy frecuente y rápido y parece ser que los poros pueden transportar en ambas direcciones indistintamente e incluso simultáneamente.
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