Question

Como se llevaba a cabo la discriminación durante la colonia

Answer 1

Si te refieres en México, es fácil.
La sociedad se estratifico en castas (clases sociales) que derivaban del origen de la gente, es decir, de la familia (o raza) a la que pertenecieran. Obviamente en la cima de la piramide social estaban los: españoles peninsulares, que eran los únicos con derechos y privilegio. Eran los únicos "ciudadanos valiosos" de la Nueva España, claro eran ricos, millonarios; muchos con cargos politicos importantes o pertenecientes al gremio militar.
Abajo de ellos, los criollos (que ha estas alturas supongo que ya sabes quienes eran) que de la misma manera pertenecían a familias de renombre, y con títulos de importancia, sin embargo "no contaban con tantos derechos como los españoles peninsulares", aunque claro, todos los criollos eran importantes y muy muy ricos, lo único era que no podían gobernar ni ocupar cargos públicos (y si algo enoja a los ricos es que no los dejen gobernar).
Después, las castas de razas puras, es decir, los indígenas que pertenecían a líneas directas de sus gentes. por esto es que no eran considerados los menores (sin embargo) es claro que los trataban muy mal y de manera deplorable.Casi ya no habían, pues los españoles, se habían encargaron de exterminarlos (a causa de las enfermedades que les contagiaron).
Ya mas abajo las personas producto de la combinación de razas, producto del llamado "mestizaje", mestizos, castizos, mulatos, moriscos, chinos, gibaros, lobos... etc.
Y aun mas al ultimo los africanos, los negros, esclavos. Estos dos últimos grupos, en especial este ultimo, tratados peor que a animales.
Claro que no he mencionado al grupo mas importante, adinerado, poderoso y dominante, (mas que cualquier español, o militar), claro es de esperarse, la iglesia católica romana mexicana, llegada desde Europa y que con mas de la mitad del territorio mexicano en sus arcas, gobernaba, manipulaba, a diestra y siniestra.