Question

Acido valproico y el valproato de magnesio son lo mismo

Answer 1

No, quimicamente, el Ácido Valproico, es un acido organico con un carboxilo libre, y causa mayor riesgo de irritacion gastrica. 
El Valproato de magnesio, es una sal de dos moleculas de acido valproico y una de Magnesio.

OJO
Al final, ambas tiene la misma actividad y acció biológica, como se usa en medicina (la principal es aumentar el umbral de descarga neuronal en el sistema nervioso central haciendolo menos sensible a estimulos internos y externos,) como sucede cuando se busca prevenir las convulsiones, y modificar la impulsividad en trastornos de la conducta, ciertos tipos de migraña, etc. 

EN CONCLUSIÓN
Químicamente los dos compuestos son diferentes, pero medicamente para la epilepsia.