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El origen del PB está asociado, al menos en parte, al de las Fuerzas Armadas Peronistas (FAP). Si bien en su origen FAP y PB mantuvieron cierta autonomía, luego confluyeron estructural e ideológicamente y el PB terminó por constituirse en lo que se definía como su "organización política de superficie", usando los términos de aquella época.3 Marcelo Raimundo plantea en su libro "Izquierda peronista, violencia armada y clase obrera: una experiencia alternativa", que las Fuerzas Armadas Peronistas y el Peronismo de Base, son dos organizaciones que formaron parte de la izquierda peronista desde su aparición pública en 1968 hasta el año 1979, donde terminan por disolverse a raíz de la caída de su dirección nacional.4 Cecilia Luvecce (autora del libro "Entre la negación y el mito: Las Fuerzas Armadas Peronistas y el Peronismo de Base 1968-1973", Centro Editor de América Latina, 1993), cuestiona la relación estrecha entre las FAP y el PB, llegando a sugerir como hipótesis futura de trabajo la existencia de varios “peronismos alternativos”.4 Referirse en conjunto a FAP-PB, puede dar a simple vista una imagen de estrecha identificación, del estilo PRT-ERP. En realidad, dicha identidad es más bien un punto de llegada, que resulta observable a nivel del desarrollo organizativo nacional, pero que no está exento de heterogeneidades regionales.4Nunca fueron un modelo clásico de organización política cerrada y analizándolas por separado, tanto el PB como las FAP pueden ser descriptas como una “federación de experiencias” a lo largo del país.3 Un ejemplo de la relación entre FAP y PB lo constituye la Revista Militancia Peronista para la liberación, conocida simplemente como Militancia, que representaba intereses afines al PB, a pesar de no ser estrictamente un órgano oficial de esa agrupación. Estaba relacionada con las FAP a punto tal que en algunos casos el PB era presentado como la agrupación de superficie de las FAP.5 Esta revista, dirigida durante los años 1973y 1974, por Rodolfo Ortega Peña y Eduardo Luis Duhalde, asumió la defensa de militantes tanto de las organizaciones de extracción peronista (FAP, Montoneros) como del ERP y FAR (luego fusionada a Montoneros en octubre de 1973). (Al ser clausurada por decreto presidencial en abril de 1974 fue reemplazada por la revista "De Frente con las bases peronistas", que se publicó entre Mayo y Julio de 1974 y que representaba intereses afines a FAP-PB).6
Existieron diferencias en la práctica cotidiana de la militancia en estos dos planos: en el PB estuvo más presente el trabajo con bases y las problemáticas concretas de trabajadores y en el caso de las FAP cobraron más importancia el análisis de las tácticas armadas más eficaces y el funcionamiento clandestino. Pero la imbricación de ambas organizaciones se fue desarrollando en la evolución política ideológica que las hizo confluir y construir juntas.3