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El municipio de San Francisco del Rincón se localiza en el estado de Guanajuato. San Francisco del Rincón colinda tanto al norte como en la zona este con el municipio de León, al sureste con Romita, en la región sur con Manuel Doblado y al oeste colinda con el municipio de Purísima del Rincón. El mapa general de la República Mexicana señala que el municipio de San Francisco del Rincón se localiza entre las coordenadas geográficas 21° 01' 22" latitud norte y 101° 51' 36" longitud oeste.
San Francisco del Rincón está constituído por una extensión territorial total de 415.73 kilómetros cuadrados y se encuentra a una altura promedio de 1,721 metros sobre el nivel del mar. Estadisticamente el Instituto Nacional de Estadística y Geografía informó que los resultados del tercer censo de población que llevó a cabo en el año 2010 en el municipio de San Francisco del Rincón, mostraron que éste está formado por una población total de 113,524