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Fue regidor y Alférez real de Santiago en 1581 y en 1593 Martín García Oñez de Loyola lo nombró su Lugarteniente de Capitán General y Corregidor de Cuyo, reedificó la ciudad de San Juan y fundó la de San Luis, pagando de su propio caudal a los soldados que lo acompañaron.
Volvió a Chile en 1596, sufrió un proceso criminal y fue condenado a una multa en dinero y confinamiento en el mismo territorio chileno.
El 22 de agosto de 1611 hizo su testamento en la ciudad de Santiago, donde falleció ese mismo año. Había contraído matrimonio en 1588 con doña Francisca de Gaete y tuvo cinco hijos: Juan, Luis, Diego, Beatriz y Luciana. Si bien el fundador de San Luis firmaba Jufré, la forma Jofré aparece ya en documentos del siglo XVII y es la que adoptan sus descendiente.