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El medio fisico de las lagunas y las charcas estan formadas por el agua que se acumula en las depreiones terrestres y la cantidad varía a lo largo del año. Sus aguas no son muy profundas dependiendo de lo turbias que esten. Contiene el menos oxigeno que el mar.
En los bordes de la laguna, la vegetación predominante son los juncos, totoras y espadañas. Hay plantas que viven sumergidas en el agua (como la cola de zorro acuática o la gambarrusa) o en la superficie (helechos de agua, hepáticas y lentejas de agua).
Las lagunas y los lagos pueden formarse de diferentes maneras, entre las cuales se pueden mencionar: las de origen tectónica, las cuales se forman por depresiones creadas por pegamentos de la corteza terrestre, las volcánicas creadas por la depresión formada después de la actividad de los volcanes, etc.
Entre los vertebrados que mas sobresalen están las serpientes acuáticas, tortugas, ranas e incluso cocodrilo. Sin embargo, son las aves más conspicuas de las especies que habitan las lagunas, como pelícano, garzas, pato, martines pescadores, flamenco, tilapia y claria.