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La diferencia entre el ARN mensajero maduro e inmaduro es que el inmaduro contiene los intrones, mientras que el maduro ha eliminado los intrones por corte y empalme y añade dos modificaciones a cada extremo de su cadena: por un lado, el extremo 3' se poliadenila, es decir, se añade una cadena larga de poli adenilato, y por otro lado se añade al extremo 5' la caperuza de 5-metilguanosina.
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