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El primer microscopio fue construido probablemente en 1590 por el fabricante de lentes holandés Zacharias Janssen. Zacharias Janssen es uno de los posibles inventores del microscopio que, según documentos de la época, habría inventado el microscopio junto a su padre Hans Martens.
En 1607 Anton van Leeuwenhoek presenta un microscopio con que se puede ver en mejor calidad que el de HH Janssen. En 1665 aparece en la obra de William Harvey sobre la circulación sanguínea al mirar al microscopio los capilares sanguíneos, y Robert Hooke publicó su obra Micrographia.
Desde la invención del microscopio se han producido importantes avances en la ciencia y la medicina. Fue fundamental, por ejemplo, para el descubrimiento de las células, los protozoarios, las bacterias, los espermatozoides, los glóbulos rojos, etc
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