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La principal diferencia entre el Reino Monera y el Protista es que en el reino Monera están todos los organismos unicelulares Procarotas, su Núcleo no esta bien organizado y falta completamente la envoltura nuclear o Carioteca, de esta manera el material genético representado por una sola molécula de ADN de tipo No histónico se encuentra compactada, plegada, y unida en uno de sus extremos al aldo interno de la membrana plasmática en un Esbozo de Núcleo primitivo o rudimentario llamado Nucleoide, en cambio los integrantes del reino Protista ( algas unicelulares, protozoos, levaduras) poseen una verdadera organización nuclear formada por la Carioteca o envoltura nuclear que aisla y separa el ADN del resto de la célula.
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