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La salinidad del suelo puede ocurrir por efectos naturales, sin embargo, la principal causa es el mal manejo de la agricultura en cuestiones como: manejo incorrecto del riego, falta de drenaje en los suelos, aplicación inadecuada de estiércoles y otros residuos animales, mal manejo de los fertilizantes y uso de aguas residuales
La salinidad tiene un efecto negativo en el desarrollo de los cultivos ya que en estas condiciones el potencial osmótico del suelo supera al del sistema de las plantas limitando así la entrada del agua en la raíz, además de ello la salinidad trae consigo otros problemas como:
Absorción limitada de los nutrimentos.
Afecta la translocación y el reciclado de iones en la planta. El exceso de ciertos iones puede provocar toxicidad en las plantas.
Acumulación de Cl, Na y B en distintas partes de las plantas, como las semillas, los tallos y las hojas.
Se producen una serie de modificaciones debido a las variaciones de pH, que afectan a la disponibilidad de los nutrimentos.
La presencia en exceso de determinados elementos, provoca antagonismos entre nitratos-cloruro, potasio-sodio, calcio-sodio