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Lina. La protagonista del cuento tiene una doble función. Por un lado, es una arqueo del género Thermoplasma (ver esquema y explicación del resumen de la teoría de Margulis). Por otro, Lina representa a Lynn Margulis, quien se enfrentó a la academia neodarwinista al proponer la simbiosis como mecanismo evolutivo basándose en estudios de otros científicos anteriores que habían caído en el olvido.
Espiroqueto. Representa las espiroquetas, unas bacterias helicoidales y móviles, una de las partes más discutidas de la teoría de Lynn Margulis.
Mitocondrio. Representa el microorganismo precursor de las mitocondrias, orgánulos encargados de suministrar la mayor parte de la energía necesaria para la actividad celular (respiración celular), de ahí lo de que le 'vaya lo de la energía’.
Darwinio. Representa a Charles Darwin, eminente científico que formuló la evolución por selección natural y en cuya teoría se ha basado la síntesis neodarwinista.
Lotería Evolutiva. Representa la aparición de novedades genéticas por mutación, de ahí que suceda cada mucho tiempo y de forma aleatoria, pudiendo ser o no ventajosa para el organismo que la sufre.
Maximiliano y Morgano: estos maestros representan la ortodoxia neodarwinista que se enfrentó a las teorías de Margulis.
Selección natural. Esta teoría formulada por Darwin explica la evolución de forma gradual y por acumulación de mutaciones para el organismo que las sufre, cuando estas mutaciones suponen una ventaja para sobrevivir en un ambiente dado. Sin embargo, no sirve para explicar sucesos bruscos en la historia (como la aparición de la célula eucariota), ya que la diferenciación y especiación por selección natural requiere periodos muy largos de tiempo para operar.
Eucariota. Ser vivo compuesto por células eucariotas, que son todas menos arqueas y bacterias. La célula eucariota, con su complejidad (que se diferencia de la procariota por tener ADN empaquetado en un núcleo, mitocondrias, cloroplastos en plantas y sistema de microtúbulos, entre otros rasgos) es la unidad elemental de plantas, animales, hongos y protistas. En el cuento Eucariota surge de la simbiosis de los personajes de Lina (Thermoplasma) y Espiroqueto, y más tarde, de su fusión con Mitocondrio (precursor de las mitocondrias), tal y como fue formulado por Margulis.
El baile de la simbiosis. La simbiosis es la asociación biológica en la que se produce un beneficio para todos los participantes de dicha interacción. En la teoría de Margulis, es el mecanismo evolutivo que originó la célula eucariota por la suma cooperativa de los microorganismos preexistentes (procariotas). En el cuento, el baile es la metáfora para esa fusión simbiótica.
Teoría de la endosimbiosis seriada. La endosimbiosis seriada de Lynn Margulis, en la que se basa El baile de las bacterias, es una teoría según la cual la célula eucariota se originó por fusión simbiótica de una arquea (microorganismos procariotas que en el pasado eran clasificados como bacterias por su morfología unicelular y procariota) y una bacteria espiroqueta. A esa fusión inicial se añadieron las mitocondrias y, en el caso de las plantas, los cloroplastos.
En “El baile de las bacterias”, Lina (Thermoplasma, una arquea) se une por simbiosis con Espiroqueto (una bacteria espiroqueta) y más tarde se incorpora Mitocondrio (que representa a un precursor de las mitocondrias). La teoría está ampliamente aceptada aunque no se ha demostrado que las espiroquetas, que fueron propuestas por Margulis como precursoras de los cilios de la célula eucariota, sean las bacterias que formaron parte de este fenómeno.
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