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El proceso de aislamiento y purificación de DNA es conseguir separar
esta molécula del resto de las macromoléculas (proteínas, lípidos y
polisacáridos) presentes en el interior de las células, se extrae de las células mediante rotura de las mismas por
homogeneización en presencia de un detergente (SDS, dodecil sulfato
sódico, lauril sulfato sódico) y gracias a la elevada fuerza iónica del
medio (NaCl 0,15 M). Las proteínas son desnaturalizadas por adición de
cloroformo al sobrenadante de la lisis celular, de manera que la
presencia de este disolvente altamente hidrofóbico induce a la
exposición hacia el exterior de las cadenas laterales de los aminoácidos
apolares, las cuales se encuentran habitualmente enterradas en el
interior de la proteína. Tras acelerar la separación de la fase acuosa y
del cloroformo por centrifugación, las proteínas tienden a localizarse
en la interfase del sistema cloroformo-agua, lo que hace disminuir
fuertemente el contenido de proteínas de la fase acuosa que contiene el
DNA. Los lípidos quedan disueltos en la fase clorofórmica. El DNA
contenido en la fase acuosa se precipita entonces por adición de etanol.
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