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Todos los desechos metabólicos se excretan en forma de soluciones acuosas a través de los órganos excretores (nefridios, tubos de Malpighi, riñones), con la excepción del CO2, que se excreta junto con el vapor de agua a través de los pulmones.
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Los artrópodos terrestres suelen ser uricotélicos, es decir, que para la excreción nitrogenada no producen amoníaco o urea, sino ácido úrico o, a veces, guanina. En los artrópodos es frecuente la excreción por acumulación, como alternativa o complemento de la excreción por secreción.
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