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Durante la década de los años 50, Moshinsky trabajó en los campos de la física nuclear teórica y desarrolló estudios sobre las reacciones nucleares y la estructura de los núcleos atómicos. Resultado de ello, introdujo el concepto de paréntesis de transformación para funciones de oscilador armónico. Desde 1947, año en que Moshinsky publicó su primer artículo, hasta el presente, su producción científica en física apareció en las mejores revistas del mundo, alcanzando cerca de trescientas publicaciones, incluyendo cinco libros que han recibido más de cinco mil referencias formales en la literatura universal. Marcos Moshinsky hizo uso del más sencillo de los sistemas físicos, el oscilador armónico, para resolver problemas en campos de la física tan diversos como las moléculas y los quarks.