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Similitud química (o similitud molecular) hace referencia a la semejanza de elementos, moléculas o compuestos químicos con respecto a cualquiera de sus características estructurales o funcionales, es decir, se refiere a la semejanza de dos o más sustancias en relación al efecto que tengan sobre elementos reactivos, ya sea en un contexto orgánico, inorgánico, biológico o de otro tipo.
La similitud química es uno de los conceptos más importantes en la quimioinformática.12En efecto, desempeña un papel importante en los enfoques modernos para varias cuestiones, tales como la predicción de las propiedades de los compuestos químicos o el diseño de productos químicos con un conjunto predefinido de propiedades. También es especialmente importante en la realización de estudios de diseño de drogas por medio análisis de grandes bases de datos que contienen estructuras químicas disponibles o potencialmente disponibles.
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