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En bacterias protistas y hongos los procesos de excreción se encuentran regulados por el transporte de sustancias a través de la membrana celular. El agua, el gas carbónico y el oxigeno ingresan y salen de sus células por transporte pasivo. Los electrolitos lo hacen por transporte activo por difusión facilitada.
Algunas bacterias anaerobias del genero Clotridium excretan acido acético como resultado del catabolismo de la glucosa las levaduras y algunas bacterias producen, además etanol y láctico, respetivamente, como desechos metabólicos de la fermentación
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