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El modelo llave-cerradura está propuesto para esquematizar la complementaridad que existe entre dos compuestos para realizar un proceso. Este modelo también implica la especificidad de un compuesto por otro.
En el caso de las enzimas, la afinidad de estas por un sustrato se explica mediante este mecanismo. Otro ejemplo son las proteinas fijadoras de penicilina que contribuyen a la construcción de la pared celular bacteriana, permitiendo su unión específica con el peptidoglicano necesario para tal fín.
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