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Debido a esta pluripotencialidad, las células madre embrionarias parecen ser buenas candidatas para obtener distintos tipos celulares y tratar un amplio abanico de enfermedades como el Parkinson, el Alzheimer, la diabetes o el infarto de miocardio. Aun así, están sin resolver las técnicas que permiten su diferenciación hacia distintos tipos celulares; también está por controlar su gran capacidad proliferativa e indeterminada, pues se ha demostrado en experimentos con animales que son inductoras tumorogénicas.
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