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La respiración aerobia es la que se realiza en presencia de oxígeno, pasando el piruvato a acetil-coenzima A (el piruvato de obtiene por la degradación de la glucosa), la cual ingesa a la mitocondria para efectuar el ciclo de Krebs y obtener energía para la célula. Esta es realizada en todas las células eucarióticas y algunos grupos de bacterias.
La respiración anaeróbica se realiza en ausencia de oxígeno, siendo el agente oxidante y aceptor de electrones, nitratos o sulfatos. Solo se realiza en algunos grupos de bacterias
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