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Los principales desafíos tienen que ver con la imprevisibilidad de la enfermedad. Aún no queda claro qué impacto tendrá un descenso en la temperatura (con la llegada del invierno) y el regreso de millones de alumnos a la escuela en el hemisferio sur. Por el momento, la tasa de mortalidad es muy elevada para aquellos que tienen 70 o más años de edad, así como personas con afecciones preexistentes. Si bien la población más joven corre un menor riesgo de complicaciones, es importante que las campañas de prevención estén dirigidas a toda la población para reducir el contagio.
Así mismo, la COVID-19 supone un desafío para la capacidad de los sistemas de salud de responder a un número fuera de la común de pacientes que necesiten los mismos servicios. En varios países, el virus llega luego de que un brote de dengue ha sobrecargado la capacidad hospitalaria. No solo los hospitales están sobrepasados; también otras áreas de atención o asistencia, como la disponibilidad de insumos médicos o una fuerza laboral está extenuada.
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