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Este tipo de digestión se observa en los protistas y esponjas. Al interior de las esponjas se encuentran las células en collar coanocitos, las que se encargan de filtrar del agua las partículas alimenticias que ingresan a la célula por endocitosis. Pequeñas partículas de alimentos son englobadas en vacuolas. La vacuola, luego, se fusiona con el lisosoma, cuyas enzimas descomponen el alimento en pequeñas fracciones.
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