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Los vegetales modificados dan muchas ventajas como: alimentos con mejores y más cantidad de nutrientes, mejor sabor en los productos creados, mejor adaptación de las plantas a condiciones de vida más deplorables, aumento en la producción de los alimentos con un sustancial ahorro de recursos, aceleración en el crecimiento de las plantas y animales, mejores características de los alimentos producidos a la hora de cocinarse, capacidad de los alimentos para utilizarse como medicamentos o vacunas para la prevención y el tratamiento de enfermedades.
Pero también tiene desventajas como: incremento de sustancias tóxicas en el ambiente, perdida de la biodiversidad, contaminación del suelo, resistencia de los insectos y hierbas indeseadas ante medicamentos desarrollados para su contención, posibles intoxicaciones debido a alergias o intolerancia a los alimentos procesados, daños irreversibles e imprevisibles a plantas y animales tratados