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Para copiar directorios completos (con todos sus archivos y subcarpetas internas):
cp -r directorio/ ruta_de_destino/nombre_copia
Lo explico:
El comando cp en Linux crea una copia.
Al escribir cp -r indicamos recursividad, es decir, que haga lo mismo con todos los elementos internos (archivos y subcarpetas)
El nombre del directorio debe terminar con una barra (/), asi indicamos que se trata de una carpeta. Sin la barra, Linux considera que estamos manejando un archivo y nos dará error.
Luego de un espacio se escribe el nombre del directorio de destino y su ruta (puede ser relativa al directorio origen o a la raiz)
Las rutas del directorio de origen y el de destino pueden ser relativas a la raiz o al directorio de trabajo actual.
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