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La Guerra contra la Confederación o Guerra de la Confederación fue un enfrentamiento militar ocurrido en América del Sur que inició en 1836 y duró hasta 1839, con batallas que se libraron principalmente en los territorios del actual Perú.
En este se enfrentaron la Confederación Perú-Boliviana, liderada por su protector Andrés de Santa Cruz; contra la Coalición Restauradora conformada por militares peruanos opuestos al proyecto de Santa Cruz, con el apoyo de los ejércitos de la República de Chile y la Confederación Argentina. Los peruanos contrarios a la Confederación, que habían sido desterrados a Chile, deseaban la reunificación del Perú por lo que pidieron el apoyo de la República de Chile, quienes en una primera campaña liderada por el chileno Manuel Blanco Encalada son derrotados en Arequipa.
La Confederación Perú-Boliviana se enfrentaría a la Confederación Argentina, dirigida por Juan Manuel de Rosas, por disputas de territoriales. la guerra terminó con la victoria de las tropas del Ejército Unido Restaurador, conformado por chilenos y peruanos restauradores, en la decisiva batalla de Yungay, determinando la disolución de la Confederación Perú-Boliviana y la expulsión de Santa Cruz del poder.