Question

cuales son los alimentos hechos con bacterias

Answer 1

el yogurt esta echo de algunas bacterias

Answer 2

 Los alimentos que se elaboran a base de bacterias (o microorganismos, como las levaduras) son los obtenidos gracias a los procesos catabólicos de "fermentación". 

Por ejemplo: 
Las bebidas alcohólicas fermentadas se realizan gracias a la fermentación alcohólica de ciertas levaduras (hongos): El vino, el pan, el mosto y la cerveza se crean gracias al hongo Sccharomyces. Es peligroso entrar a lugares en donde se estén produciendo estos productos si el precinto no está bien ventilado debido a que unos de los productos de la fermentación alcohólica es el CO2, que resulta tóxico. 

El Yogur que "se come" se crea mezclando en leche (normalmente destilada) ciertas bacterias anaeróbicas como las Lactobacillus bulgaricus y las Streptococcus thermophilus. Estas bacterias fermentan la leche, utilizando la lactosa (azúcar de la leche) para crear el denominado ácido láctico. Es interesante saber que, por ejemplo, las células musculares de nuestro cuerpo también pueden realizar este tipo de reacción química (por eso se las denominan células anaerobias facultativas). 

Hay más microorganismos (hongos y bacterias) que son utilizados en la industria hostelera, pero estos 2 son los más que más te preguntan en selectividad (PAU - pruebas de acceso a la universidad).