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Las causas de este enfrentamiento son varias en las que se puede destacar la mala delimitación limítrofe de Ecuador, ya que los conflictos internos condujeron a que el estado reste atención a las regiones alejadas como Jaén y Mainas.
Este enfrentamiento que duró casi cinco semanas, puso fin a una larga serie de incidentes bélicos entre las dos naciones por el control territorial de una zona en disputa desde comienzos del siglo XIX, que comprendía la Cordillera del Cóndor y el río Cenepa.
En el Acta de Brasilia firmada el 24 de octubre de 1998 por el presidente Jamil Mahuad y su homónimo peruano Alberto Fujimori, ratifica la paz de Itamaraty en donde los 20 Km² que pertenece al sector de Twinza pertenece al Perú y se le concede al Ecuador 1 km² de Twinza como propiedad privada pero bajo la legislación del Perú.
Como una de las consecuencias más notables, es la pérdida de vidas en el campo de batalla y cuantiosas pérdidas económicas para ambos países lo que provoca que el pueblo sea el más golpeado por la guerra.
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