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Desde la independencia de Rusia, el escenario político ha sido inestable y conflictivo. En ausencia de unas claras provisiones constitucionales que delineen el poder y resuelvan conflictos entre la rama ejecutiva y la legislativa, el problema fue resuelto por la fuerza en octubre de 1993. Cuando Yeltsin disolvió el parlamento en septiembre los lideres de la oposición armada y los diputados conservadores ocuparon el edificio del parlamento y se rehusaron a salir de el. Tropas fieles a Yeltsin asaltaron el edificio y arrestaron a los líderes de la oposición, dejaron más de 100 muertos.
Yeltsin subsiguientemente hizo una nueva constitución, que fue aceptada por el electorado en diciembre de 1993. Bajo la nueva constitución el poder del presidente se expandió a expensas de la legislatura, esto permitió a Yeltsin acelerar su programa de reformas económicas. Tanto en las elecciones de diciembre de 1993 y las de 1995 dieron a los opositores de Yeltsin, los comunistas y nacionalistas rusos la mayoría de los asientos en la legislatura.
En las elecciones presidenciales de 1996, a pesar de todo, Yeltsin derroto a su oponente comunista Gennady Zyuganov. La victoria de Yeltsin fue posible gracias a su alianza con sectores con intereses financieros que controlaban los medios. El partido de Zyuganov en realidad era movido por una nostalgia de los días de gobierno de la Unión Soviética, en vez de proponer respuestas reales a los problemas de Rusia. La elección de Yeltsin mostraba que el electorado continuaba disgustado con mucho de lo llevado a cabo en la era comunista, que no creían en la restauración de los viejos tiempos y su preferencia por la estabilidad y continuidad que representa Yeltsin.
En marzo de 1998, Yeltsin inexplicablemente despidió al Primer Ministro Chernomyrdin y al resto de su gabinete. Yeltsin nombró a Sergey Kiriyenko, como Primer Ministro. La economía de Rusia continuaba su camino hacia la decadencia, y a mediados de 1998 Yeltsin destituyo a Kiriyenko e intento reinstalar a Chernomyrdin. El parlamento denegó la nominación de este para Primer Ministro, aprobando otro escogido por Yeltsin, el ministro de Relaciones Exteriores Yevgeny Primakov, en septiembre de ese mismo año. En mayo de 1999 Yeltsin despidió a Primakov, criticándolo por fallar en revivir la economía de Rusia. Una semana después, el parlamento aprobó la elección de Yeltsin como sucesor de Primakov, el Ministro del Interior Sergey Stepashin.
Stepashin no duro mucho, En agosto del 1999 Yeltsin lo despidió junto con todo el gabinete, y nomino como Primer Ministro al jefe del Servicio de Inteligencia Domestica Vladimir Putin. Yeltsin señalo que cuando su termino terminara en julio de 2000, el quería que Putin fuera su sucesor como presidente.
En diciembre 31 de 1999 Yeltsin renuncio inexplicablemente, nombro a Putin como presidente interino. Yeltsin dijo que era tiempo de abrirle paso a una nueva generación de líderes. La renuncia de Yeltsin parece haber sido planeada para ayudar a Putin a tener más oportunidades de ganar las elecciones presidenciales. En las elecciones presidenciales en marzo de 2000, Putin salio electo para un termino completo como presidente ganando un 53% de los votos. Los observadores internacionales catalogaron las elecciones de "limpias pero injustas" ya que Putin y sus aliados tenían el control de los medios televisivos. Putin fue reelecto en las elecciones presidenciales de 2004 con un amplio margen de un 74% frente a su contrincante más cercano del partido comunista con solo un 14%. De nuevo los observadores internacionales y sectores rusos pro democracia dijeron que Putin y sus seguidores controlaban los medios