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Cuando hablamos de ecosistemas nos referimos al complejo sistema de relaciones que existe entre las comunidades de organismos vivos (biocenosis) y el medio ambiente en el que habitan (hábitat o biotopo).
Esto se refiere tanto a la dependencia mutua entre las diversas especies de seres vivos involucradas, como al flujo de la energía y/o la materia que tiene lugar en el medio físico, entendiendo estos procesos como un todo organizado y recíproco.
No debemos confundir el ecosistema con el bioma. Este último término se usa para aludir las diversas áreas o regiones geográficas del planeta, tomando en cuenta su clima, su topografía y también en cuenta su presencia animal o vegetal, pero que funcionan como unidades geográficas homogéneas. Un mismo bioma puede contener diversos ecosistemas.
Dentro de un ecosistema tienen lugar diversas cadenas tróficas (alimentarias) también llamadas de transmisión de la materia, ya que existe un circuito de descomponedores (hongos, bacterias, etc.), productores (vegetales, plantas, fitoplancton, etc.) y consumidores: herbívoros (roedores, rumiantes, etc.) y también depredadores primarios y secundarios (grandes felinos, aves de rapiña, cánidos salvajes, etc.).