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La clasificación de los hongos siempre ha sido un arduo rompecabezas para los expertos. Sin embargo, en los últimos tiempos parece haberse alcanzado el consenso para ubicar las especies conocidas en cinco grandes familias. A continuación analizamos cada una de ellas.
Se calcula que el Reino Fungi está compuesto de 1,5 millones de especies, de las cuales apenas ha sido clasificado el 5% del total. A pesar de que todavía quedan muchas otras por descubrir, en la actualidad se acepta como válida la clasificación de las especies conocidas en cinco grandes familias de hongos.
A saber, las tres primeras se componen por hongos incapaces de producir setas u hongos menores. Respecto a las dos últimas familias, todos los Basidiomicetos son hongos mayores capaces de producir setas, mientras los Ascomicetos pueden ser hongos mayores o menores, según la especie.