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La actividad microbiana se desarrolla en función de factores intrínsecos y extrínsecos al sistema suelo, por lo cual constituye un indicador de la dinámica del suelo y de la salud del recurso, pues una buena actividad microbiana puede ser el reflejo de óptimas condiciones físicas y químicas que permitan el desarrollo
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Los factores involucrados en la actividad microbiana (temperatura, pH, humedad, disponibilidad de O2, nutrientes inorgánicos, accesibilidad al sustrato, etc.) ... Las prácticas de cultivos ejercen numerosos efectos biológicos directos e indirectos sobre las poblaciones microbiales del suelo.
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