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La respiración aeróbica es propia de los organismos eucariontes como: plantas, animales, hongos, protistas y de algunos tipos de bacterias. La respiración anaeróbica la realizan exclusivamente algunos grupos de bacterias como: Pseudomonas, Bacillus, Clostridium, Thermoplasma
Los intestinos de animales superiores.
El lecho marino y las grietas abisales.
Las esclusas geotérmicas por donde el magma brota hacia el fondo del mar.
Los géiseres, aguas termales y otras formas de brote geotermal.
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