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El papa Juan Pablo ll, en su carta dirigida a la academia pontificia de ciencias, refiriéndose a la teoría de la evolución, manifiesto "que la evolución física del hombre y las otras especies es ya mas que una hipótesis". Sin embargo, en la misma carta deja en claro que la iglesia considera el alma humana como una creación divina inmediata y no sujeta al proceso evolutivo. Señala además que durante los últimos años, una serie de descubrimientos provenientes de diferentes esferas del conocimiento, han llegado a construir un argumento poderoso a favor de esta teoría.
La Teoría de la Evolución de las especies fue por primera vez elaborada por Charles Darwin, y para su planteamiento se basó fundamentalmente en la observación directa de las diferentes especies y sus relaciones entre sí. En los años actuales, la teoría de un origen único de la vida, que partiendo de lo más simple, habría evolucionado a los más complejo, se ha visto muy apoyada con el descubrimiento de la molécula básica de la vida: el ácido desoxirribonucleico (DNA). Es ésta la molécula que, mediante un código ya descifrado, regula y ordena la vida de todos los organismos vivos de la Tierra, desde un virus o una bacteria, pasando también por las células vegetales, hasta llegar a los animales superiores, incluyendo a la especie humana.
El DNA es una larga molécula, y trozos de ellas constituyen los genes. Cada uno de estos genes codifica una proteína, moléculas que son las encargadas de realizar determinadas funciones en el interior de la célula o en ocasiones fuera de ella (hormonas). Las diferentes enzimas que permiten las reacciones bioquímicas en el interior de las células, son también proteínas. También éstas forman parte de la compleja estructura celular.