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Debido a los descubrimientos en la Sima de los Huesos en Atapuerca , en 1994, aparecen dos líneas evolutivas y a los estudios genéticos, hoy se tiene la perspectiva de dos líneas evolutivas. La primera desarrollada en Asia y Europa desembocó en el Homo heidelbergensis y a partir de éste en el Homo neandertalensis;[7] y la segunda, desarrollada originalmente al interior de África, devino en el Homo rhodesiensis y posteriormente en el Homo sapiens. Esta teoría deja abierto el debate sobre el lugar de origen del Homo erectus y su relación con las especie Homo ergaster y Homo georgicus. Parece claro en cambio, que el Homo floresiensis es el resultado de una adaptación especializada del H. erectus en un hábitat limitado.
La hipótesis de las dos líneas evolutivas es coherente con los estudios genéticos que sustentan la teoría del origen único en África del Homo sapiens, y en cambio se opone a la hipótesis del origen multirregional, que supone la aparición simultánea del H. sapiens en Asia y África.
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