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La prevención de muchas enfermedades infecciosas y otras patologías, como las alergias, las enfermedades autoinmunes y el cáncer, suponen todavía un gran reto en el siglo XXI. Se han conseguido ya grandes logros, como la erradicación de algunas enfermedades y el control de otras muchas, y los avances en nuevas tecnologías en las areas de la biología molecular, el ADN recombinante, la bioquímica de proteínas, la bacteriología y la inmunología nos permiten predecir que en los próximos años se seguirá progresando. Los aspectos técnicos serán refinados de tal forma que cualquier antígeno o epitopo podrá ser presentado de manera altamente inmunogénica. Estas tecnologías modernas han llevado a la formulación de un paradigma en la investigación de vacunas en el que la genómica y/o proteómica de las enfermedades se analizan a priori con el fin de identificar los factores que estarían implicados en la respuesta inmune, y que podrían ser adecuados como candidatos vacunales.