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Los microorganismos patógenos se encuentran con distintos estímulos ambientales a lo largo de su vida. Por ejemplo, para muchos patógenos un cambio muy importante es la temperatura: no es lo mismo vivir en el exterior a una temperatura ambiente de 18ºC que dentro de un huésped a 37ºC, donde además la bacteria se encuentra con una multitud de factores en contra suya como el sistema inmune u otros sistemas de defensa. Por eso, las bacterias han desarrollado mecanismos para saber y enterarse dónde se encuentran y poder cambiar su comportamiento (la expresión de sus genes) y adaptarse según el ambiente: la temperatura, la acidez o el pH, los nutrientes disponibles, ....
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