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Según por lo que pude leer un poco, ellos no querian que nacieran personas mestizas.
"El mestizaje generó un sistema de castas en los territorios del Nuevo Mundo, de este modo, ya en 1549, Carlos V prohibió que mulatos, mestizos y cualquier hijo ilegítimo pudiera acceder a cualquier cargo municipal, posición pública o repartimiento en las Indias.
No tener sangre pura española era signo de inferioridad, y cuanta más sangre españolase tuviera, mayor era la jerarquía social del individuo.
incluso para tener acceso a la educación superior había que presentar un examen de «pureza de sangre»."
Ademas de la esclavitud que ambos presentaron, se puede decir que estos querían evitar que existieran personas de clases "inferiores".
No puedo asegurar que fue por el trabajo, ya que ambos fueron escogidos para el trabajo pesado, aunque si puedo decir, que entre estas razan pudo haber existido diferencias, dependiendo del tipo de trabajo que tenian.
Espero que te haya servido ^^