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Entre las variedades de árboles estaban: (robles, cedros, pinos, entre otros. La temperatura en la zona montañosa era fría, templada en las partes bajas y en suelos volcánicos.
Las tribu del valle, clasificaron los suelos, subdividiéndolos en cinco partes: atocina, (suelos fértiles; palataliza, (suelos arenosos); atetilla, (suelos pedregosos); cualitativo, (suelo limoso, enriquecidos por árboles caídos); tlalauiac, (tierra con estiércol); esto se puede constatar en los códices Vengara y el de Santa María Asunción. El Herbario de Badiana, muestra la variedad de suelos, en tanto a la labor científica o botánica. Habían dos palabras en naguatlato que los españoles pusieron mucha atención: equidiste, (suelos malos o impregnados de sales); te petate, (suelos de caliche, cascarilla de piedra de cal, no aptos para la agricultura, por ser in fértiles).